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在仪器提供的63°C恒温条件下，核酸片段进行特异性扩增，扩增片段与荧光染料结合，在470nm光源激发下产生520nm荧光信号，此荧光信号被荧光探测器检测，经微处理器处理，实时回执扩增曲线，并根据设置的阈值自动判断阴阳性结果。

恒温荧光检测系统可应用在多个领域，食品安全、水产养殖病害、宠物传染病、植物病害、科研等，如食品工业链条中食品安全生物因素的检测，对致病微生物检测、转基因原料鉴别、掺假掺杂鉴别等；水产养殖病害的检测，如流行病原的监测、养殖风险因素的控制、产地检疫、苗种检疫、亲代检疫等；宠物传染病检测，帮助宠物医生更有效、准确地进行病症的诊断与治疗，节约检测时间与检查费用；其优点是检测快速、准确、操作简便、可在现场检测、适合基层人员使用。